Eugène Villon fut rapidement reconnu dans le monde artistique et fut primé dès son arrivée à Lyon et à Paris.

Au Salon lyonnais tout d’abord :

• 1905 : Médaille d’honneur

• 1908 : 3^ème médaille

• 1909 : 2^ème médaille

• 1911 : 1^ère médaille (hors concours).

• 1913 : Médaille d’honneur hors concours pour l’aquarelle Heure de l’angélus et 1^ère Médaille pour une étude au pastel de Mme Winckler.

• 1925 : Médaille d’honneur

• 1940 : Prix de la Société hors concours

Au salon de la Société des Artistes Français 

• 1931 : Mention honorable pour les dessins, cartons et aquarelles.

• 1932 : Médaille d’argent dans la catégorie des peintures avec une œuvre intitulée Après la pluie, le Faou ou Portail de la cathédrale de Bourges.

• 1934 : Médaille d’or de la peinture à l’huile avec une peinture nommée Marché de Strasbourg.

• 1937 : Médaille d’argent à l’Exposition internationale avec une aquarelle Matinée de printemps

ll devient membre de la société des Artistes Français à Paris dès 1910.

Pour son investissement en tant que professeur il reçut en 1912 du ministre de l’Instruction publique et des Beaux Arts la décoration d’officier d’Académie. Et en 1918 il fut nommé officier de l’Instruction publique et des beaux-arts.

Enfin pour l’intégralité de son oeuvre Villon fut fait en août 1937 Chevalier de la Légion d’honneur. Cette décoration lui fut remise par le président Albert Lebrun.